從某一方面來說，牛奶是牛的母乳，只不過，現在母乳一詞基本代指人類的母乳了。

不知道題主說的牛奶是配方奶/奶粉還是擠出來的鮮奶。先說說擠出來的鮮奶營養差異吧。

1、鮮奶營養成分對比

人類母乳和牛奶鮮奶的營養成分是非常豐富的，不僅富含各種種類齊全的氨基酸（合成蛋白質的單位）、脂肪酸（能量、細胞膜、部分體內激素的合成等各種組織需要）、維生素、礦物質、抗菌因子等，還有促進嬰兒生長發育必不可少的生長因子、免疫球蛋白等等，畢竟是要提供全面的營養給嬰兒和牛犢，非常全面，易吸收。

人和牛的需求不完全一致，因此一些具體的營養物質還是有差異的（可能會有過敏反應），但不妨礙牛奶依舊是替代母乳比較理想的產品。以前在奶牛場做實驗的時候，我們試過給牛犢喝羊奶（羊奶有點臊味），小牛喝過一口后，就再也不喝了，還是傾向于牛奶，物種之間還是傾向于本來的。

人類母乳是最適合人類嬰兒的食物，沒有之一。而且，母乳會根據嬰兒的生長，調整營養配比，如初乳免疫球蛋白比較多，后面的話，免疫球蛋白就很少了。

當然，這些說得都是剛擠出來不久的乳汁，牛奶也是，放久了抗菌因子會損耗，就會有細菌繁殖了。比方說牛奶擠出來還要經過巴氏消毒，延緩細菌生長。更大的考驗是為了保存活性物質，這種鮮奶一般保質期短，盡量喝完。

至于說腸道菌群，牛奶和母乳不背這個鍋，因為要嚴格控制細菌數，鮮奶中本來就有抗菌因子保護新生嬰兒腸道免遭細菌的繁殖。新生嬰兒腸道很脆弱，至少經過初乳之后建立初步的免疫系統后，才有能力慢慢容納腸道菌群的繁殖，嬰兒拉稀是很痛苦的事情。腸道菌群更多的是后天攝入的建立。

2、配方奶/奶粉成分對比

奶粉的話，或者說配方奶的話，因為都干燥消毒過了，很多活性物質物質都沒了，營養也沒有母乳齊全，但對嬰兒的影響肉眼看不出來，因為基本的營養物質需求都能滿足，也好在根據不同階段有不同配方，比較省心。

所以從營養角度上建議，早期盡量用母乳，實在沒辦法，用鮮牛奶（如果不過敏），最后才考慮用奶粉或配方奶。

營養成分上，我找到這一張，國際母乳會的資料對比。